В качестве профилактики заболевания стоит отметить мероприятия, которые подразумевают обнаружение больных с наличием гистолитической амебы в группах риска, а так же их санацию. Кроме того необходимо проводить лечение и разорвать механизм передачи инфекции.
К группам риска относятся пациенты с патологиями в желудочно-кишечном тракте. А так же жители населённых пунктов, где сточные воды не канализованы и сотрудники предприятий, занимающихся производством и реализацией пищевой продукции. Разумеется, лица, которые возвращаются из эндемичных по амебиазу стран, попадают в группу риска, так же как и гомосексуалисты.
Все люди, которые поступают на работу на предприятия пищевой промышленности, должны проходить копрологическое обследование. В случае обнаружения дизентерийной амебы все они подлежат санации. Раз в год проводятся и плановые обследования, которые призваны обезопасить людей, попадающих в группу риска от опасности заболевания. Соответствующие лечебно-профилактические учреждения должны проводить обследования пациентов, которые больны заболеваниями кишечника в острой или хронической форме.
В течение двенадцати месяцев осуществляется так же и диспансерное наблюдение всех граждан, которые перенесли амебиаз. При обнаружении дисфункции кишечника проводит лабораторное обследование, которое может носить и плановый характер, однако лишь раз в квартал. До полной санации от воздействия вируса, возбуждающего амебиаз, находятся работники предприятий пищевой промышленности, а так же учреждений, приравненных к ним.
Механизм передачи подразумевает защиту некоторых объектов, находящихся во внешней среде, от воздействия загрязняющими инвазионными материалами. К подобным мерам можно относить канализование населённых пунктов, а так же обеспечение проживающих там людей чистой питьевой водой и проведение обеззараживания предметов, которые подвергались воздействию со стороны больного при помощи химических средств. Санитарно-просветительская работа играет немаловажную роль в профилактике инфекции.